Смотри также: Как показывать видео на DokuWiki сайте

Для конвертирования видео файлов из одного формата в другой на Линуксе обычно используется программа ffmpeg, и Убунту здесь не исключение, но с приветом. Например, на Ubuntu Trusty в репозиториях ffmpeg нет, а на Ubuntu Wily есть. Но с другой стороны на Ubuntu Trusty есть avconv, который мало чем отличается от ffmpeg.

Устанавливаем avconv:

sudo apt-get update
sudo apt-get install libav-tools

Конвертируем видео командой:

avconv -i input -c:v libtheora -c:a libvorbis -q:v 6 -q:a 5 output.ogv

input – файл любого видео формата.